يتم توصيل الأمعاء الدقيقة بعد حوالى 180-200 سم من بدايتها بالجراب المعدى المخلق فى المرحلة الأولى من العملية. وبذلك يمر الغذاء من الفم إلى الجراب المعدى المخلق ثم إلى الأمعاء الدقيقة مُتخطياً بذلك جزئ كبير من المعدة والأمعاء الدقيقة. وبهذه الطريقة، فإن عملية تحويل مسار المعدة تجمع بين إنشاء الجراب المعدى أو المعدة الصغيرة المخلقة للحد من كمية الطعام التى يمكن تناولها فى الوجبة الواحدة مع أجراء تحويل لمسار الطعام ليمر مباشراً إلى الأمعاء الدقيقة متجاوزاً بذلك جزء كبير من المعدة و الاثني عشر و جزئ من الأمعاء الدقيقة (حوالى 180-200 سم) مما يتسبب فى سوء الامتصاص للسعرات الحرارية والمواد المغذية من الطعام.

مثل تحويل مسار المعدة التقليدى هذه العملية تخفض كمية الطعام الذي يمكن تناولها في الوجبة الواحدة، فإن الجراب المعدى أو المعدة الصغيرة المخلقة تمتلئ بحوالي نصف كوب من الطعام.

عندما يمتلئ هذا الجراب المعدى بالطعام ويتمدد يقوم بإرسال إشارات إلى المخ أنك تشعر بالشبع الكامل ويجب التوقف عن الأكل و إذا حاولت أن تأكل أكثر من ذلك، فأنك قد تشعر بألم في البطن وغثيان أوحتى القيء.

بالإضافة إلى ذلك، هذا النوع من الجراحة هو أكثر ملاءمة لآكلي الحلويات (الأشخاص الذين يأكلون السكريات و الحلويات بشكل مفرط) ، لأنهم إذا تناولوا الكثير من السكريات قد يشعرون بموجة من الغثيان أو تقلصات في البطن مع شعور بالإغماء.

جراحة تحويل مسار المعدة المصغرة تقلل من حجم المعدة وكذلك القدرة على امتصاص السعرات الحرارية و تؤدى بصفة عامة إلى فقدان ثلثي الوزن الزائد في خلال عامين. وقد أظهرت الدراسات أنه بعد إجراء جراحة تحويل مسار المعدة المصغرة يظهر تحسناً ملموساً في مرض السكري من النوع الثانى (مع إحتمال إختفأه تماماً)، وارتفاع ضغط الدم، وارتفاع الكولسترول وتوقف التنفس أثناء النوم في خلال سنة بعد العملية